Prenatalni test genetskog zdravlja bebe – hromozomske i DNK analize

Kako se test izvodi

Krv se uzima u posebnu epruvetu sa sredstvom za stabilizaciju slobodne cirkulišuće van-ćelijske DNK. DNK se zatim prečišćava iz plazme u potpuno automatizovanom sistemu, a dobijeni molekuli sekvenciraju se na platformi za sekvenciranje sledeće generacije (NGS) u laboratoriji Genoma Life Sciences.

Bioinformatički sistem analizira podatke tako što prebrojava sekvence koje pripadaju svakom hromozomu i upoređuje ih sa setom referentnih hromozoma. Aneuploidija se prepoznaje kada je broj sekvenci znatno viši ili niži od očekivanog. Postupak ide u ovim koracima:

• prečišćavanje fragmenata slobodne fetalne DNK iz krvi majke,
• priprema fragmenata za formiranje registra, odnosno biblioteke,
• imobilizacija biblioteke pomoću čipa za sekvenciranje,
• sekvenciranje biblioteke tehnologijom NGS (Next Generation Sequencing),
• analiza dobijenih informacija bioinformatičkim sistemom.

Da bi rezultat bio validan i da bi se smanjila verovatnoća lažno pozitivnog i lažno negativnog nalaza, obavljaju se dodatne provere: izračunavanje fetalne frakcije, provera kvaliteta šablona za pripremu podataka i provera samih sekvenciranih podataka. Ceo proces je automatizovan, uz praćenje reagenasa i uzoraka od prijema epruvete do izdavanja rezultata.

Ograničenja testa

Test otkriva numeričke i određene strukturne hromozomske anomalije i validiran je za hromozome 21, 18, 13, X i Y. Validiran je za trudnoće sa jednim detetom kada je trudnoća stara najmanje 10 nedelja, odnosno za blizanačke trudnoće od 12 nedelja. Preporučuje se genetsko savetovanje pre i posle testiranja.

Rezultat ne isključuje mogućnost da se u trudnoći jave druge hromozomske ili subhromozomske abnormalnosti, anomalije ploda na rođenju i druge komplikacije. Nalaz „Aneuploidija nije detektovana„ne isključuje u potpunosti prisustvo hromozomskih poremećaja, kao što su trizomije 21, 18 ili 13, aneuploidije polnih hromozoma ili mikrodelecije, odnosno moguć je lažno negativan rezultat.

Kako se tumači pozitivan nalaz

Nalazi „Aneuploidija je detektovana„i „Detektovan visok rizik od mikrodelecije„smatraju se pozitivnim rezultatom. Za konačnu dijagnostičku potvrdu potrebna je invazivna procedura, kao što je amniocenteza ili uzorkovanje horionskih čupica.

Postoji mala mogućnost lažno pozitivnog rezultata, kada je nalaz pozitivan iako je plod hromozomski normalan, zbog prisustva specifične DNK koja cirkuliše u krvi majke. Takva stanja su ograničeni mozaicizam placente, sindrom nestalog blizanca i urođena ili stečena anomalija kod majke.

Kod blizanačkih trudnoća, kada se aneuploidija otkrije, status pojedinačnog ploda ne može se utvrditi. Ako je zahtevano određivanje pola, biće naznačeno prisustvo Y hromozoma ili da su oba ploda ženskog pola, jer ograničen broj podataka kod blizanačkih trudnoća ne dopušta detaljniji nalaz.